ГУ \"Институт охраны здоровья детей и подростков АМН Украины\" был организован в октябре 1922 г. в г. Харькове как первый Украинский государственный институт охраны материнства и детства (Приказ Народного Комиссариата здравоохранения Украины № 174 от 28.10.1922; первый директор С.М. Ямпольский). Согласно приказу МЗ Украины № 40 от 18.01.65 г. учреждение было реорганизовано в Харьковский НИИ здравоохранения детей и подростков им. Н.К. Крупской. С этого времени Институт стал ведущим научно-исследовательским учреждением в Украине по вопросам организации медицинского обеспечения детей школьного возраста и подростков. В 1974 году было завершено строительство нового комплекса с собственной клинико-лабораторной базой. По постановлению Кабинета Министров Украины от 07.08.2000 № 1232 институт вошёл в состав Академии медицинских наук Украины.

За время существования в институте сформировались известные научные школы: “Артериальная гипертензия и предвестники атеросклероза у детей и подростков”; “Ревматология детского и подросткового возраста”; “Детская и подростковая гинекология”; “Детская и подростковая эндокринология”; “Гигиена детей и подростков”, “Радиационная педиатрия”.

Основными направлениями научно-исследовательской работы института в современный период являются:

- определение закономерностей формирования здоровья школьников Украины, факторов среды и наследственных факторов, которые его предопределяют; разработка систем мониторинга;
- определение нейрогормональних и иммунных механизмов обеспечения развития детского организма и формирование патологии пубертатного периода;
- разработка новых методов профилактики, диагностики, прогноза течения и лечения заболеваний сердечно-сосудистой, пищеварительной, эндокринной систем, соединительной ткани, психических расстройств в подростковом возрасте;
- медико-психологическая реабилитация детей и подростков с наиболее тяжелой соматической патологией и нарушениями психического развития, профилактика инвалидности;
- научное обоснование наиболее эффективных форм медицинского обеспечения детей и подростков Украины, в том числе из групп высокого риска.

В институте в разные времена работали известные научный работники и организаторы здравоохранения Украины, среди которых - первый директор института проф. С.М. Ямпольский; доктор мед. наук, профессор, Заслуженный деятель науки Украинской ССР О.И. Корнилова, которая возглавляла институт 34 года (1952 -1986 гг.); доктор мед. наук, профессор, Действительный член Академии наук Украины, Заслуженный деятель науки и техники Украины, лауреат Государственных премий в области науки и техники, В.И. Грищенко, проф. М.И. Олевский, проф. М.Л. Кошкин, проф. Л.М. Мерков, проф. С.Я. Шаферштейн, проф. В.И. Константинов, А.П. Лагунова, проф. В.О. Сарана, проф. Р.С. Мирсагатова, проф. В.Я. Гайдай, проф. Л.Я. Стулий, проф. Н.А. Дмитрова, проф. Э.З. Юсфина, проф. Т.Г. Софиенко, проф. А.А. Беседина, Л.Ф. Куликова, Г.Н. Костюрина.

Сегодня в институте работает 70 научных сотрудников, 52 врача, среди которых 4 заслуженных враче Украины, 2 заслуженных работники здравоохранения Украины, 12 докторов и 52 кандидата медицинских наук. Один научный сотрудник имеет почетное звание «Заслуженного деятеля науки и техники Украины», 73 специалиста имеют высшую и первую квалификационные категории.

Институт является ведущим научным учреждением в стране, координирующим исследования в области проблемы “Охрана здоровья детей школьного возраста и подростков”, принимает участие в повышении квалификации врачей, проводит Украинские, региональные и областные научно-практические конференции и научные симпозиумы по актуальным вопросам физиологии и патологии детей и подростков, обеспечивает оказание высококвалифицированной лечебно-консультативной помощи детскому и подростковому населению, готовит кадры высшей квалификации.